| アイテムタイプ |
共通アイテムタイプ(1) |
| 公開日 |
2025-05-20 |
| タイトル |
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タイトル |
Oligolysine Enhances and Inhibits DNA Condensate Formation |
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言語 |
en |
| 著者 |
Ohno, Hiroaki
Kijima, Junko
Ochi, Yosuke
Shoji, Masaaki
平, 順一
Mabuchi, Takuya
佐藤, 佑介
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| 著作権関連情報 |
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権利情報Resource |
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ |
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権利情報 |
Copyright (c)2025 The Authors. Published by American Chemical Society. This publication is licensed under CC-BY-NC-ND 4.0 . |
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言語 |
en |
| 抄録 |
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内容記述タイプ |
Abstract |
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内容記述 |
The formation of biomolecular condensates via phase separation relates to various cellular functions. Reconstituting these condensates with designed molecules facilitates the exploration of their mechanisms and potential applications. Sequence-designed DNA nanostructures enable the investigation of how structural design influences condensate formation and the construction of functional artificial condensates. Despite the high designability of DNA-based condensates, free nanostructures that do not assemble into condensates remain a challenge. Combining DNA nanostructures with other molecules, such as peptides, represents a promising approach to overcoming the limitations of DNA condensates and gaining a deeper understanding of molecular condensates. Herein, we report the effects of cationic oligolysines with several residues on DNA condensate formation assembled from Y-shaped DNA nanostructures. DNA condensate formation was enhanced by oligolysines at an appropriate L/P ratio, which refers to the ratio of positively charged amine groups in lysine (L) to negatively charged nucleic acid phosphate groups (P). Oligolysines with five residues enhanced condensate formation while maintaining the sequence-specific interaction of DNA. In contrast, oligolysines inhibited condensate formation depending on the L/P ratio and residue number. This was attributed to nanostructure deformation caused by oligolysines. These results suggest that the amount and length of cationic peptides significantly affect the self-assembly of branched DNA nanostructures. This study offers important insights into biomolecular condensates that can guide further development of DNA/peptide hybrid condensates to enhance the functions of artificial condensates for use in artificial cells and molecular robots. |
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言語 |
en |
| 書誌情報 |
en : ACS Omega
巻 10,
号 15,
p. 15781-15789,
発行日 2025-04-07
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| 出版社 |
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出版者 |
American Chemical Society |
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言語 |
en |
| キーワード |
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言語 |
en |
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主題Scheme |
Other |
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主題 |
Deformation |
| キーワード |
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言語 |
en |
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主題Scheme |
Other |
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主題 |
Genetics |
| キーワード |
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言語 |
en |
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主題Scheme |
Other |
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主題 |
Monomers |
| キーワード |
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言語 |
en |
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主題Scheme |
Other |
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主題 |
Nanostructures |
| キーワード |
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言語 |
en |
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主題Scheme |
Other |
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主題 |
Peptides and proteins |
| 言語 |
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言語 |
eng |
| 資源タイプ |
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資源タイプ識別子 |
http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 |
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資源タイプ |
journal article |
| 出版タイプ |
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出版タイプ |
VoR |
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出版タイプResource |
http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 |
| DOI |
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識別子タイプ |
DOI |
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関連識別子 |
https://doi.org/10.1021/acsomega.5c01928 |
| 助成情報 |
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助成機関識別子タイプ |
Crossref Funder |
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助成機関識別子 |
https://doi.org/10.13039/501100001700 |
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助成機関名 |
文部科学省 (MEXT) |
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言語 |
ja |
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助成機関名 |
Ministry of Education, Culture, Sports, and Science (MEXT) |
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言語 |
en |
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研究課題番号タイプ |
JGN |
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研究課題番号 |
JP23H04427 |
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研究課題番号URI |
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PUBLICLY-23H04427/ |
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研究課題名 |
細胞接着をモデルとしたリポソームの組織化技術の開発 |
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言語 |
ja |
| 助成情報 |
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助成機関識別子タイプ |
Crossref Funder |
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助成機関識別子 |
https://doi.org/10.13039/501100001691 |
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助成機関名 |
日本学術振興会 (JSPS) |
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言語 |
ja |
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助成機関名 |
Japan Society for the Promotion of Science (JSPS) |
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言語 |
en |
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研究課題番号タイプ |
JGN |
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研究課題番号 |
JP20K19918 |
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研究課題番号URI |
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20K19918/ |
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研究課題名 |
外部刺激により形成・消失を制御可能な人工オルガネラの創成と分子ロボットへの実装 |
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言語 |
ja |
| 助成情報 |
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助成機関識別子タイプ |
Crossref Funder |
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助成機関識別子 |
https://doi.org/10.13039/501100001700 |
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助成機関名 |
文部科学省 (MEXT) |
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言語 |
ja |
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助成機関名 |
Ministry of Education, Culture, Sports, and Science (MEXT) |
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言語 |
en |
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研究課題番号タイプ |
JGN |
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研究課題番号 |
JP24H00070 |
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研究課題番号URI |
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-24H00070/ |
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研究課題名 |
分子-ディジタル融合によるArtificial Liquid Intelligenceの創製 |
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言語 |
ja |
| 助成情報 |
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助成機関識別子タイプ |
Crossref Funder |
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助成機関識別子 |
https://doi.org/10.13039/501100001691 |
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助成機関名 |
日本学術振興会 (JSPS) |
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言語 |
ja |
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助成機関名 |
Japan Society for the Promotion of Science (JSPS) |
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言語 |
en |
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研究課題番号タイプ |
JGN |
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研究課題番号 |
JP23K17860 |
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研究課題番号URI |
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23K17860/ |
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研究課題名 |
DNAナノデバイスの複合化で挑む多応答性ヒドロゲルの創出 |
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言語 |
ja |
| 助成情報 |
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助成機関識別子タイプ |
Crossref Funder |
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助成機関識別子 |
https://doi.org/10.13039/501100001700 |
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助成機関名 |
文部科学省 (MEXT) |
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言語 |
ja |
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助成機関名 |
Ministry of Education, Culture, Sports, and Science (MEXT) |
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言語 |
en |
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研究課題番号タイプ |
JGN |
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研究課題番号 |
JP24H01152 |
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研究課題番号URI |
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PUBLICLY-24H01152/ |
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研究課題名 |
分子の自在配置制御によるスマートレセプタ機構の創出 |
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言語 |
ja |
| 助成情報 |
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助成機関識別子タイプ |
Crossref Funder |
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助成機関識別子 |
https://doi.org/10.13039/501100001700 |
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助成機関名 |
文部科学省 (MEXT) |
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|
言語 |
ja |
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助成機関名 |
Ministry of Education, Culture, Sports, and Science (MEXT) |
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言語 |
en |
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研究課題番号タイプ |
JGN |
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研究課題番号 |
JP23H04396 |
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研究課題番号URI |
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PUBLICLY-23H04396/ |
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研究課題名 |
人工DNAチャネルを用いたプロトン透過および膜貫通制御システムの分子論的設計 |
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言語 |
ja |
| 助成情報 |
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助成機関識別子タイプ |
Crossref Funder |
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助成機関識別子 |
https://doi.org/10.13039/501100001700 |
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助成機関名 |
文部科学省 (MEXT) |
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言語 |
ja |
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助成機関名 |
Ministry of Education, Culture, Sports, and Science (MEXT) |
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言語 |
en |
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研究課題番号タイプ |
JGN |
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研究課題番号 |
JP21H05887 |
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研究課題番号URI |
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PUBLICLY-21H05887/ |
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研究課題名 |
脂質二重膜で機能するヘリックスペプチドを利用したミニマルインターフェイスの構築 |
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言語 |
ja |
| 助成情報 |
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助成機関識別子タイプ |
Crossref Funder |
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助成機関識別子 |
https://doi.org/10.13039/501100001700 |
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助成機関名 |
文部科学省 (MEXT) |
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|
言語 |
ja |
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助成機関名 |
Ministry of Education, Culture, Sports, and Science (MEXT) |
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言語 |
en |
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研究課題番号タイプ |
JGN |
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研究課題番号 |
JP20H05970 |
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研究課題番号URI |
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PLANNED-20H05970/ |
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研究課題名 |
ミニマル人工脳のための情報伝達分子デバイスの開発 |
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言語 |
ja |
| 助成情報 |
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助成機関識別子タイプ |
Crossref Funder |
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助成機関識別子 |
https://doi.org/10.13039/501100001691 |
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助成機関名 |
日本学術振興会 (JSPS) |
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言語 |
ja |
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助成機関名 |
Japan Society for the Promotion of Science (JSPS) |
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言語 |
en |
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研究課題番号タイプ |
JGN |
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研究課題番号 |
JP23H01336 |
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研究課題番号URI |
https://kaken.nii.ac.jp/ja/grant/KAKENHI-PROJECT-23K26031/ |
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研究課題名 |
人工相分離構造体による可逆性動的反応場の制御と分子論的理解 |
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言語 |
ja |
| 助成情報 |
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助成機関識別子タイプ |
Crossref Funder |
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助成機関識別子 |
https://doi.org/10.13039/501100001691 |
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助成機関名 |
日本学術振興会 (JSPS) |
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|
言語 |
ja |
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助成機関名 |
Japan Society for the Promotion of Science (JSPS) |
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言語 |
en |
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研究課題番号タイプ |
JGN |
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研究課題番号 |
JP24K03034 |
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研究課題番号URI |
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-24K03034/ |
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研究課題名 |
リポソーム膜の空間的制御を可能にする新規裏打ち構造の創出 |
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言語 |
ja |
| 助成情報 |
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助成機関識別子タイプ |
Crossref Funder |
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助成機関識別子 |
https://doi.org/10.13039/501100020964 |
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助成機関名 |
創発的研究支援事業（JST-FOREST） |
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言語 |
ja |
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助成機関名 |
Fusion Oriented REsearch for disruptive Science and Technology (JST-FOREST) |
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言語 |
en |
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研究課題番号タイプ |
JGN |
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研究課題番号 |
JPMJFR212H |
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研究課題番号URI |
https://doi.org/10.52926/JPMJFR212H |
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研究課題名 |
ナノ空間反応性イオン輸送制御システムの創出 |
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言語 |
ja |
| 助成情報 |
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助成機関識別子タイプ |
Crossref Funder |
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助成機関識別子 |
https://doi.org/10.13039/501100020964 |
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|
助成機関名 |
創発的研究支援事業（JST-FOREST） |
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|
言語 |
ja |
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助成機関名 |
Fusion Oriented REsearch for disruptive Science and Technology（JST-FOREST） |
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言語 |
en |
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研究課題番号タイプ |
JGN |
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研究課題番号 |
JPMJFR2344 |
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研究課題番号URI |
https://projectdb.jst.go.jp/grant/JST-PROJECT-24013571/ |
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研究課題名 |
分子ロボットオペレーティングシステムの構築 |
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言語 |
ja |
| ISSN |
|
|
収録物識別子タイプ |
EISSN |
|
収録物識別子 |
2470-1343 |
| 査読の有無 |
|
|
値 |
yes |
| 研究者情報 |
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URL |
https://hyokadb02.jimu.kyutech.ac.jp/html/100001534_ja.html |
| 論文ID（連携） |
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|
値 |
10451269 |
| 連携ID |
|
|
値 |
14487 |
10451269.pdf (4.9 MB)
