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  1. 学術雑誌論文
  2. 4 自然科学

XOR Gate Design Toward a Practical Complete Set for DNA Computing

http://hdl.handle.net/10228/00008088
http://hdl.handle.net/10228/00008088
414a79b5-67ab-4450-b26d-b5a2aca4acf8
名前 / ファイル ライセンス アクション
s00354-020-00090-3.pdf s00354-020-00090-3.pdf (578.8 kB)
アイテムタイプ 学術雑誌論文 = Journal Article(1)
公開日 2021-03-22
資源タイプ
資源タイプ識別子 http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
資源タイプ journal article
タイトル
タイトル XOR Gate Design Toward a Practical Complete Set for DNA Computing
言語
言語 eng
著者 Nishijima, Katsuhiro

× Nishijima, Katsuhiro

WEKO 29505

Nishijima, Katsuhiro

Search repository
中茎, 隆

× 中茎, 隆

WEKO 29506
e-Rad 30435664
Scopus著者ID 8253328800
九工大研究者情報 100000656

en Nakakuki, Takashi

ja 中茎, 隆

ja-Kana ナカクキ, タカシ


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抄録
内容記述タイプ Abstract
内容記述 Practical design of the XOR gate is an important milestone in the field of DNA computing. In this study, we aim to develop an enzyme-free XOR gate driven by a toehold-mediated strand displacement mechanism possessing the true detection property. The advantages of our design are as follows: dual-rail logic is not required, the explicit use of the NOT gate is avoided, the circuit structure is simple, and the design is achievable with fewer DNA strands than that designed by the combination of four NAND gates. A rational circuit design is performed and the dynamic behaviors of the biochemical reaction and the secondary structures of DNA strands are confirmed by computer simulation. In particular, both the domain-level design technique with G-T mismatched base pairs and base sequence-level fine-tuning are successfully achieved to alleviate the performance degradation arising from unintended and leaky reactions present in the circuit. The validity of the XOR gate design is confirmed by experimental studies.
書誌情報 New Generation Computing

巻 38, p. 285-301, 発行日 2020-03-21
出版社
出版者 Springer
DOI
関連タイプ isVersionOf
識別子タイプ DOI
関連識別子 https://doi.org/10.1007/s00354-020-00090-3
日本十進分類法
主題Scheme NDC
主題 461
NCID
収録物識別子タイプ NCID
収録物識別子 AA10468773
ISSN
収録物識別子タイプ ISSN
収録物識別子 0288-3635
ISSN
収録物識別子タイプ ISSN
収録物識別子 1882-7055
著作権関連情報
権利情報 Copyright (c) Ohmsha, Ltd. and Springer Japan KK, part of Springer Nature 2020. This is a post-peer-review, pre-copyedit version of an article published in New Generation Computing. The final authenticated version is available online at: http://dx.doi.org/10.1007/s00354-020-00090-3.
キーワード
主題Scheme Other
主題 Dynamic DNA nanotechnology
キーワード
主題Scheme Other
主題 Strand displacement mechanism
キーワード
主題Scheme Other
主題 Exclusive OR gate
出版タイプ
出版タイプ AM
出版タイプResource http://purl.org/coar/version/c_ab4af688f83e57aa
査読の有無
値 yes
連携ID
値 8195
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Ver.1 2023-05-15 13:25:16.987165
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