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A Selective G-Quadruplex DNA-Stabilizing Ligand Based on a Cyclic Naphthalene Diimide Derivative
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
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molecules-20-10963.pdf (2.8 MB)
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| Item type | 学術雑誌論文 = Journal Article(1) | |||||||||||||||||||||||||||||
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| 公開日 | 2016-05-20 | |||||||||||||||||||||||||||||
| 資源タイプ | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 | |||||||||||||||||||||||||||||
| 資源タイプ | journal article | |||||||||||||||||||||||||||||
| タイトル | ||||||||||||||||||||||||||||||
| タイトル | A Selective G-Quadruplex DNA-Stabilizing Ligand Based on a Cyclic Naphthalene Diimide Derivative | |||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | eng | |||||||||||||||||||||||||||||
| 著者 |
Md., Monirul Islam
× Md., Monirul Islam× Fujii, Satoshi× 佐藤, しのぶ
WEKO
5963
× 岡内, 辰夫
WEKO
880
× 竹中, 繁織
WEKO
6749
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| 抄録 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 内容記述タイプ | Abstract | |||||||||||||||||||||||||||||
| 内容記述 | A cyclic naphthalene diimide (cyclic NDI, 1), carrying a benzene moiety as linker chain, was synthesized and its interaction with G-quadruplex DNAs of a-core and a-coreTT as a human telomeric DNA, c-kit and c-myc as DNA sequence at promoter region, or thrombin-binding aptamer (TBA) studied based on UV-VIS and circular dichroism (CD) spectroscopic techniques, thermal melting temperature measurement, and FRET-melting assay. The circular dichroism spectra showed that 1 induced the formation of different types of G-quadruplex DNA structure. Compound 1 bound to these G-quadruplexes with affinities in the range of 106–107 M−1 order and a 2:1 stoichiometry. Compound 1 showed 270-fold higher selectivity for a-core than dsDNA with a preferable a-core binding than a-coreTT, c-kit, c-myc and TBA in the presence of K+, which is supported by thermal melting studies. The FRET-melting assay also showed that 1 bound preferentially to human telomeric DNA. Compound 1 showed potent inhibition against telomerase activity with an IC50 value of 0.9 μM and preferable binding to G-quadruplexes DNA than our previously published cyclic NDI derivative 3 carrying a benzene moiety as longer linker chain. | |||||||||||||||||||||||||||||
| 書誌情報 |
Molecules 巻 20, 号 6, p. 10963-10979, 発行日 2015-06-12 |
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| 出版社 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 出版者 | MDPI | |||||||||||||||||||||||||||||
| DOI | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 関連タイプ | isIdenticalTo | |||||||||||||||||||||||||||||
| 識別子タイプ | DOI | |||||||||||||||||||||||||||||
| 関連識別子 | https://doi.org/10.3390/molecules200610963 | |||||||||||||||||||||||||||||
| ISSN | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | EISSN | |||||||||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子 | 1420-3049 | |||||||||||||||||||||||||||||
| 著作権関連情報 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 権利情報 | Copyright (c) 2015 by the authors; licensee MDPI, Basel, Switzerland. This article is an open access article distributed under the terms and conditions of the Creative Commons Attribution license (http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/). | |||||||||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||||||||||
| 主題 | cyclic naphthalene diimide | |||||||||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||||||||||
| 主題 | G-quartet | |||||||||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||||||||||
| 主題 | human telomeric DNA | |||||||||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||||||||||
| 主題 | promoter region | |||||||||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||||||||||
| 主題 | promoter region | |||||||||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||||||||||
| 主題 | thrombin-binding aptamer | |||||||||||||||||||||||||||||
| 出版タイプ | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 出版タイプ | VoR | |||||||||||||||||||||||||||||
| 出版タイプResource | http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 | |||||||||||||||||||||||||||||
| 査読の有無 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 値 | yes | |||||||||||||||||||||||||||||
| 研究者情報 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| URL | https://hyokadb02.jimu.kyutech.ac.jp/html/395_ja.html | |||||||||||||||||||||||||||||
| 連携ID | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 値 | 5457 | |||||||||||||||||||||||||||||
